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Puriney's Notes

Puriney=purine+Y, my Wonderland

 
 
 
 
 
 

欲说还休

2014-7-9 3:18:42 阅读786 评论3 92014/07 July9

少年不识愁滋味,爱上层楼。爱上层楼,为赋新词强说愁。

而今识尽愁滋味,欲说还休。欲说还休,却道天凉好个秋。

也不知道何时开始,上来就问“为什么”、“什么意思”,许多事情开始不过大脑。我不生产代码,我只是stackoverflow的搬运工?不能归因于此。生物实验是啥结果就得接受,嗯,我也不能这么耍赖。难道真如评论说的,对Google搜索的依赖正在开始改变普通人思考模式与知识获取习惯?总之,看到这词时我张嘴就问老婆:“啥意思?”

我好歹高中语文也常年保持110+,若是自己看,肯定是能明白。现在回想回想,我究竟什么时候开始变地如此“笨”?以至于笨地让人心烦?萌,偶尔卖,感觉确实萌萌哒;恶意卖甚至不自觉习惯卖,就时心智不全。

异地着实考验人心智情商。已婚人士后送点儿礼物买点儿东西,大概总得和老婆商量着来,钱尽量使在刀刃上,买想要的。万万没想到,女人虽然手握粮草调度大权,但对“礼物”与“惊喜”的期待却丝毫不随岁月退散。“钱都在我手上,我想要礼物和惊喜”。矛盾的是,老公都全额缴钱了,被打赏的零花钱能买个啥?

说到惊喜,我觉得我的剧本没法给惊喜。啥事都商量啥事都汇报。就好像老师喜欢学生好奇,但讨厌十万个为什么。

貌似惊喜的幸福剧本要有一个小曲折:偷偷买,被喷乱花钱,幸福。最后皆大欢喜啪啪啪。

也罢,今天天气晴朗,有些风,气温适宜出行。

唉,有些话,也就吐槽在博客了,不过万一被老婆看见了咋整?!凑合凑合用iPad写吧,竟然还特么是html文本。不象网页版各种即写即能看到的按钮和操作,来吧,各种span战个痛快。

作者  | 2014-7-9 3:18:42 | 阅读(786) |评论(3) | 阅读全文>>

PDF与PMF区别

2014-5-11 9:24:59 阅读862 评论0 112014/05 May11

概率质量函数(PMF)和概率密度函数(PDF)不同之处在于:概率质量函数是对离散随机变量定义的,本身代表该值的概率;概率密度函数是对连续随机变量定义的,本身不是概率,只有对连续随机变量的概率密度函数在某区间内进行积分后才是概率。(引自维基百科

作者  | 2014-5-11 9:24:59 | 阅读(862) |评论(0) | 阅读全文>>

绘图技巧

2014-4-21 7:11:28 阅读293 评论0 212014/04 Apr21

作者  | 2014-4-21 7:11:28 | 阅读(293) |评论(0) | 阅读全文>>

跨界为王

2014-4-21 7:10:09 阅读292 评论0 212014/04 Apr21

作者  | 2014-4-21 7:10:09 | 阅读(292) |评论(0) | 阅读全文>>

科学上网

2014-1-19 3:38:09 阅读368 评论0 192014/01 Jan19

作者  | 2014-1-19 3:38:09 | 阅读(368) |评论(0) | 阅读全文>>

[多巴胺] 小学生毕业了想写点啥可就又上路了 (2)

2013-12-8 21:59:31 阅读501 评论1 82013/12 Dec8

上半年退了硕博辞了工作陪了女友娶了老婆蹭个老师忽悠张机票,秒回国18天,我又回来了,又和老婆在一起了。这过程想想都很闹心,说没有过对未来的不安与彷徨,这都是假话,无奈无以言说罢了。

当一个一元二次方程无解时,说出问题来不如藏在自己心里。一方面,倒不是因为很“男人”地独力承担而对家人善意谎言,只是说出来,家里人,尤其是外婆,也只是干着急地喊:要抓紧啊一定要办好啊。这种反馈,既不包含任何实际解决方案也没有人道主义关怀,只是让自己更别扭罢了。看着曾经儿时心中的大伞无助的样子,他们真的是老了,我也真的是成人了。另一方面,这也不是逃避现实,反倒是越在泥沼中,借着那肉眼不能查见、超过人心所能预见的平安与喜乐,抓住那心里最后一丝丝把握,幸存了下来。更加觉得,一切的经历,虽然折磨人,但都在承受上限之内。每一次的经历,都是一次扩大度量的机会。眼前的坎,自己觉得力不能胜,要的就是这种效果。毕竟化蝶之前谁又能预想能破茧而出?看似无解的一元二次方程,只是你还不知道虚数而已。

过完一个小坎,回过头来觉得当时那么傻。但当时真的是那么傻。我们曾经想过在境内更换签证,或者去大枫叶国申请F2,尝试着身边朋友各种没经历过的,希望我们夫妻不分开。而我竟然被枫叶国拒签了,彻底断了后续的方案,准备的各种材料也全都白费。那时我在加拿大驻美使馆里取回我被拒签的签证,背后贴着申请费的收据,最后一行写着“Mercy”。我坐在那儿,真的是彻底傻眼了。好在那看不见的道路高过我们自己设计的道路,我很庆幸我那时还能“凡事赞美凡事谢恩”,现在能坐在这儿随写博客、身边躺着睡梦中的妻子。

其实说起妻

作者  | 2013-12-8 21:59:31 | 阅读(501) |评论(1) | 阅读全文>>

致老婆的那些模型与算法之韩梅梅 (1)

2013-11-3 10:28:20 阅读921 评论0 32013/11 Nov3

老婆我想一个人静静

静静?静静是谁!!!

韩梅梅,HMM, Hidden Markov Models,隐马模型。至于定义维基百科甚至百度皆可不再赘述。 现在哪里都能看见其踪影,部分因为韩梅梅真地太亲和,就像画图一样直观上让我们一窥序列本质。韩梅梅在生物里的用处之一,举个例子,给你一段序列:

CTTCATGTGAAAGCAGACGTAAGTCA

如何推测可变剪切位点的位置?

在撕开韩梅梅的外衣前,我们谈谈大概怎么扯开?可变剪切位点是分开exon和intron的界限,而在该界限左右两边,exon和intron的属性本质上是不同的,最明显的不同是四种碱基的分配比例。所以找可变剪切位点的问题,就转化为怎样确定一个边界,能使得左右两边各自都非常非常像exon和intron,在各自碱基比例上都比较吻合exon和intron的属性。正经一点儿说,对于韩梅梅,exon和intron是两种状态(state),需要做的是基于看得见的序列,逆向地去推断看不见的状态,这正是梅梅同学韩姓的来源(后续再扯)。

Multinomial Model生成DNA序列

在逆向推断之前,先正向来思考,基于已知碱基比例,如何生成序列。 假设这段序列四种碱基的概率分别是这样的:

PA=0.2PC=0.3PG=0.3PT=0.2

在R语言里,只需要这么做即可:

> nucleotides <- c("A", "C", "G", "T") # 四种碱基 > probabilities1

作者  | 2013-11-3 10:28:20 | 阅读(921) |评论(0) | 阅读全文>>

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