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Puriney's Notes

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【bio】【更正】关于上一篇“CLIP-seq与质谱、转录组与蛋白质组的邂逅”中错误  

2012-06-02 15:36:06|  分类: Bio |  标签: |举报 |字号 订阅

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【bio】CLIP-seq与质谱、转录组与蛋白质组的邂逅   http://joseph.yy.blog.163.com/blog/static/509739592012521912992/
错误已经在原文中用红色部分高亮。
原文提到的并不是CLIP-seq,没有CLIP-seq这么高级。

CLIP-seq此时经过UV交联之后会得到一串mRNA-protein如串珠;之后会用RNA酶消化RNA-protein complex之间没有protein结合的RNA序列,从而念珠装会被消解为一个个独立的珠子。之后再测序。

与之不同,这里是基于mRNA 3‘会有polyA,用oligo dT来拽取并除去没有被protein结合(或者此时更准确地说是包裹)的mRNA,剩下的mRNA则是被protein结合的,即得到研究对象。

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