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Puriney's Notes

Puriney=purine+Y, my Wonderland

 
 
 

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【R】R与统计刷初级技能书籍推荐  

2012-10-03 23:38:05|  分类: Bio |  标签: |举报 |字号 订阅

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一直自己参看了几本关于R与统计方面的书籍,撷取这篇paper里“A Quick Guide to Teaching R Programming to Computational Biology Students“的内容并附上豆瓣读书里的链接地址,如下:

【专“籍”推荐】
For a general introduction to R, 

Introductory Statistics with R  provides a nice balance of introducing R and showing its application to classical statistical testing; 

Introduction to Probability with R  goes further into aspects of probability. 

A First Course in Statistical Programming with R  introduces R as a programming language; 

书籍方面个人更喜欢A First Course in Statistical Programming with R ,可以很快地一览R语言在基本统计里如何编程如何应用。另外一本A Handbook of Statistical Analyses Using R, Second Edition则更显的“功利”些,如其名一样,个人每次都当作类工具书。不过作为中文用户,我想必读书目应该是《现代统计图形》(谢益辉)

Finally, for students wishing to explore the graphing facilities of R, R Graphics  is recommended.  

至于数据图形化,ggplot2是个不错的选择,你可以选择读懂ggplot2 : Elegant Graphics for Data Analysis进而系统读懂它。基本的绘图如柱状图等个人觉得如果真发paper是用不到ggplot2此等高端技能作为渲染的,只有那些非常需要色彩对比来表现图表信息的,才会用得到。 这句话收回,因为从ENCODE计划的大paper的统计图来看,都是用的ggplot2,差点丢了主流装11利器

【章节介绍】
Several texts focus on aspects of computational biology. 

First, the introductory text on Computational Genome Analysis  provides worked examples in R throughout the book. 

Stochastic Modelling for Systems Biology uses R to demonstrate modelling in systems biology. 

An advanced book for those already familiar with R is R Programming for Bioinformatics  

至于这本书,个人觉得类似于Perl Programming for Biologists的感觉,传输的基本内容,个人感觉是属于花一天时间逛几个大神的论坛就能彻底揣摩清楚的。

Finally, a general text for biological modelling is Dynamical Models in Biology. Although the book does not describe R, the online supplementary information provides a comprehensive introduction to R and shows how to use R to simulate the models discussed in the book, along with numer- ous exercises (http://www.cam.cornell.edu/,dmb/DMBsupplements.html).  


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